153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3205 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 627 aa  1278    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.63 
 
 		 1389 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.06 
 
 		 1606 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.16 
 
 		 1371 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.13 
 
 		 1162 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1059 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.7 
 
 		 2772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.41 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27.49 
 
 		 799 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 886 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  32.81 
 
 		 2454 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.81 
 
 		 2807 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2367 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  36.79 
 
 		 2421 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2411 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  29.18 
 
 		 662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.45 
 
 		 1620 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1287 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.68 
 
 		 822 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  29.18 
 
 		 637 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.46 
 
 		 4071 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1259 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.32 
 
 		 1602 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1488 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.88 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  37.93 
 
 		 2064 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.68 
 
 		 750 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.23 
 
 		 636 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.77 
 
 		 650 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.15 
 
 		 2833 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1193 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  22.81 
 
 		 808 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  39.29 
 
 		 815 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1245 aa  90.5  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1064 aa  90.5  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  42.53 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1139 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.81 
 
 		 3227 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.06 
 
 		 890 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  26.15 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  25.55 
 
 		 726 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1313 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  37.72 
 
 		 6497 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 1483 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  25.75 
 
 		 1152 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.8 
 
 		 1466 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.3 
 
 		 885 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.98 
 
 		 2296 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1547 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  39.36 
 
 		 2005 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.67 
 
 		 1526 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.83 
 
 		 1266 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  36.96 
 
 		 3737 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  24.19 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  38.38 
 
 		 3958 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.63 
 
 		 2927 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1066 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.02 
 
 		 1222 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  24.77 
 
 		 1230 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  30.46 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  23.09 
 
 		 3542 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25.48 
 
 		 774 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  41.77 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.71 
 
 		 2377 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 4896 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  28 
 
 		 1097 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  23.42 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 		 5298 aa  67.4  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  40.86 
 
 		 871 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1100 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  33.65 
 
 		 4044 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  23.42 
 
 		 938 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.71 
 
 		 2364 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  32.71 
 
 		 860 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.12 
 
 		 4429 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  28.91 
 
 		 2980 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.96 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  37.93 
 
 		 3602 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  39.62 
 
 		 2478 aa  64.7  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  41.67 
 
 		 2267 aa  64.7  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  27.2 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.39 
 
 		 1288 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1228 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1147 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.27 
 
 		 3324 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1634 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.21 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.03 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  28.47 
 
 		 1140 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  23.44 
 
 		 2972 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.13 
 
 		 3793 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.47 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  30.96 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  34.88 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  34.33 
 
 		 888 aa  60.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  30.25 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  36.36 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.87 
 
 		 2588 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.63 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>