132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2684 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1152 aa  2373    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  38.35 
 
 		 1111 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.27 
 
 		 1230 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.6 
 
 		 2554 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.9 
 
 		 1862 aa  229  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.98 
 
 		 3295 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  26.82 
 
 		 801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  28.44 
 
 		 812 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.07 
 
 		 1531 aa  165  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  30.29 
 
 		 761 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 1620 aa  121  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  27.89 
 
 		 1532 aa  115  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  30.77 
 
 		 603 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 1602 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  28.49 
 
 		 886 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1313 aa  88.2  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26 
 
 		 1606 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  22.87 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1287 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  28.03 
 
 		 808 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.61 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.38 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  40.38 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.85 
 
 		 4071 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25 
 
 		 2833 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.34 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  31.25 
 
 		 2402 aa  71.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.17 
 
 		 1222 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  26.44 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.32 
 
 		 1463 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  26.69 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1488 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  26.01 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  31.13 
 
 		 1483 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  23.02 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1547 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  23.28 
 
 		 799 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1980 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.53 
 
 		 3793 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1059 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  25.29 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  25.51 
 
 		 938 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  23.82 
 
 		 1371 aa  65.1  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1259 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  36.97 
 
 		 968 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1245 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  25.07 
 
 		 749 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.67 
 
 		 1466 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  26.71 
 
 		 541 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  37.62 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.64 
 
 		 3227 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1067 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  24.8 
 
 		 794 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  36.36 
 
 		 950 aa  62  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.32 
 
 		 1389 aa  61.6  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.66 
 
 		 1288 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.57 
 
 		 1657 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.75 
 
 		 1162 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  25.95 
 
 		 496 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.56 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  34.51 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.21 
 
 		 792 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  38.55 
 
 		 2377 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.35 
 
 		 3737 aa  58.9  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  41.89 
 
 		 3324 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  38.75 
 
 		 615 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.62 
 
 		 2772 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1139 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  24.32 
 
 		 742 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  25.66 
 
 		 1387 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  39.08 
 
 		 735 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.39 
 
 		 1266 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.39 
 
 		 5745 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.82 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  37 
 
 		 751 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  34.69 
 
 		 315 aa  55.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  37.65 
 
 		 2270 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 696 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 4896 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  35.37 
 
 		 689 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  23.68 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1329 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.47 
 
 		 711 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  38.75 
 
 		 3602 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.87 
 
 		 2927 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.84 
 
 		 2296 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.23 
 
 		 4429 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33 
 
 		 2807 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.41 
 
 		 940 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.5 
 
 		 3927 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31 
 
 		 540 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  37.33 
 
 		 2421 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.74 
 
 		 2454 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  30.33 
 
 		 969 aa  51.6  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  37.33 
 
 		 2367 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  37.33 
 
 		 2411 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  30.33 
 
 		 963 aa  51.6  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  24.24 
 
 		 941 aa  51.6  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1210 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.55 
 
 		 750 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>