30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0346 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  100 
 
 		 812 aa  1627    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  36.89 
 
 		 801 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  32.05 
 
 		 2554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.85 
 
 		 3295 aa  258  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.66 
 
 		 1862 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30.82 
 
 		 1531 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  32.91 
 
 		 1532 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  29.41 
 
 		 1152 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.49 
 
 		 1230 aa  181  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  35.06 
 
 		 761 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  33.41 
 
 		 603 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1111 aa  128  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  32.32 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  40.16 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.15 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2034  hypothetical protein  38.46 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  25.73 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.56 
 
 		 940 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  24.47 
 
 		 485 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  28.33 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.15 
 
 		 3507 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  27.5 
 
 		 471 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.84 
 
 		 688 aa  52.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.27 
 
 		 430 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.51 
 
 		 436 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.14 
 
 		 1272 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  25.24 
 
 		 439 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  20.82 
 
 		 501 aa  48.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  21.58 
 
 		 403 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  26.24 
 
 		 456 aa  44.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>