102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3967 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  100 
 
 		 950 aa  1959    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  80.42 
 
 		 968 aa  1598    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  45.39 
 
 		 963 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  46.06 
 
 		 969 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  33.15 
 
 		 836 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0245  hypothetical protein  32.2 
 
 		 364 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  31.95 
 
 		 373 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  28.42 
 
 		 735 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  36.29 
 
 		 2833 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1980 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.47 
 
 		 938 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  38.71 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1313 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  38.71 
 
 		 2377 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  27.67 
 
 		 751 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  27.54 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  31.97 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  34.19 
 
 		 2980 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 1152 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.48 
 
 		 581 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  33.61 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  27.66 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  38.78 
 
 		 599 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  36.56 
 
 		 4429 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1059 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1163 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  33 
 
 		 535 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  35.16 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  37.63 
 
 		 4896 aa  59.3  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.78 
 
 		 1606 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  33.88 
 
 		 1230 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  35.05 
 
 		 3737 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.22 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.91 
 
 		 799 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  27.23 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.61 
 
 		 792 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.84 
 
 		 1222 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  37.5 
 
 		 694 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  31.58 
 
 		 2402 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  34.41 
 
 		 1466 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  36.17 
 
 		 534 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.22 
 
 		 540 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  34.53 
 
 		 808 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.02 
 
 		 1483 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  34.34 
 
 		 496 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.33 
 
 		 3542 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.56 
 
 		 3927 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  36.67 
 
 		 3602 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.67 
 
 		 3227 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  38.16 
 
 		 711 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  34.38 
 
 		 4071 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 		 885 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  34.02 
 
 		 886 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  34.67 
 
 		 561 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 2972 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35.11 
 
 		 6497 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.85 
 
 		 750 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  31.45 
 
 		 636 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 662 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.41 
 
 		 3471 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  30.08 
 
 		 648 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.29 
 
 		 429 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 627 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  34.25 
 
 		 650 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1287 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  39.34 
 
 		 642 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.16 
 
 		 3324 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  34.38 
 
 		 315 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 3793 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  26.99 
 
 		 1779 aa  52  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  31.18 
 
 		 1140 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  29.27 
 
 		 657 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  30.85 
 
 		 1463 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  29.41 
 
 		 532 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  26.02 
 
 		 3851 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1245 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.41 
 
 		 1371 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  39.78 
 
 		 815 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  31.58 
 
 		 2005 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1547 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  35.21 
 
 		 640 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.07 
 
 		 2927 aa  48.5  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.57 
 
 		 5745 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1228 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28 
 
 		 3682 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 1620 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1259 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1488 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  32.29 
 
 		 615 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  31.86 
 
 		 890 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  30.21 
 
 		 503 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  32.26 
 
 		 1389 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 1602 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29 
 
 		 2270 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  36.71 
 
 		 3958 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  30.53 
 
 		 496 aa  45.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1064 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.79 
 
 		 2772 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  25.41 
 
 		 689 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>