More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2588 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  100 
 
 		 815 aa  1634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  46.29 
 
 		 652 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.43 
 
 		 1371 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.04 
 
 		 1389 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  33.6 
 
 		 1230 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.65 
 
 		 1987 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.24 
 
 		 1620 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.41 
 
 		 2036 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.83 
 
 		 1842 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1682 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.02 
 
 		 1882 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.33 
 
 		 1300 aa  111  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  29.8 
 
 		 561 aa  111  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1064 aa  111  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.84 
 
 		 822 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.03 
 
 		 752 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  33.67 
 
 		 1120 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.07 
 
 		 2272 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1547 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.56 
 
 		 792 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 958 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.62 
 
 		 1969 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.59 
 
 		 978 aa  104  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 2554 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.54 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1059 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.27 
 
 		 2000 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.72 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.06 
 
 		 1528 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.64 
 
 		 713 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.27 
 
 		 679 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  33.1 
 
 		 1241 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  31.99 
 
 		 575 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.56 
 
 		 2122 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  28.82 
 
 		 859 aa  97.4  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.25 
 
 		 735 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.88 
 
 		 547 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1667 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  25.99 
 
 		 750 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.65 
 
 		 685 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.42 
 
 		 1606 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.9 
 
 		 1602 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.27 
 
 		 1094 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.98 
 
 		 1667 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.07 
 
 		 1862 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.75 
 
 		 408 aa  94.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.1 
 
 		 669 aa  94.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.77 
 
 		 2772 aa  94.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 5298 aa  94  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  34.52 
 
 		 581 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.23 
 
 		 861 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  39.29 
 
 		 627 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  34.94 
 
 		 560 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.1 
 
 		 675 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  34.69 
 
 		 460 aa  91.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  28.52 
 
 		 719 aa  91.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 823 aa  91.3  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.48 
 
 		 786 aa  90.9  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.49 
 
 		 658 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1259 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 791 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 802 aa  88.2  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  28.93 
 
 		 870 aa  88.2  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.13 
 
 		 940 aa  88.2  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  41.07 
 
 		 1162 aa  87.8  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.49 
 
 		 845 aa  87.8  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.7 
 
 		 930 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  30.36 
 
 		 528 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.99 
 
 		 3227 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  30.42 
 
 		 1356 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.64 
 
 		 1526 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.89 
 
 		 2454 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.95 
 
 		 2411 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.89 
 
 		 2421 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  28 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1313 aa  85.9  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.95 
 
 		 2367 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  43.75 
 
 		 799 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.33 
 
 		 2807 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  36.49 
 
 		 2552 aa  85.1  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  29.93 
 
 		 1361 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  29.8 
 
 		 677 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.38 
 
 		 1288 aa  84.7  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1193 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.53 
 
 		 1732 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  33.14 
 
 		 184 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 3295 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.64 
 
 		 1236 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  34.42 
 
 		 769 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1139 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.67 
 
 		 777 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1066 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.34 
 
 		 910 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.37 
 
 		 840 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.72 
 
 		 930 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.51 
 
 		 963 aa  82.8  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  31.84 
 
 		 819 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 		 2296 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  33.48 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.05 
 
 		 3682 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>