More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1783 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  72.74 
 
 		 1356 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  83.13 
 
 		 1732 aa  1138    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 2554 aa  5008    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.88 
 
 		 1862 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  64.21 
 
 		 3295 aa  1067    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  71.12 
 
 		 1380 aa  609  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  47.16 
 
 		 848 aa  599  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.2 
 
 		 1531 aa  490  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  43.03 
 
 		 2272 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  47.81 
 
 		 823 aa  450  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44.75 
 
 		 802 aa  426  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  52.64 
 
 		 1842 aa  414  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  51.65 
 
 		 870 aa  413  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  54.48 
 
 		 575 aa  411  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  52.23 
 
 		 978 aa  406  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  54.69 
 
 		 2036 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  53.36 
 
 		 1882 aa  400  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 		 845 aa  396  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  53.72 
 
 		 1361 aa  392  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  52.25 
 
 		 2122 aa  393  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  47.84 
 
 		 1094 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.53 
 
 		 719 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.03 
 
 		 752 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.58 
 
 		 2000 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  51.66 
 
 		 1682 aa  380  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.46 
 
 		 528 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  72.11 
 
 		 787 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  48.62 
 
 		 735 aa  367  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  49.88 
 
 		 561 aa  367  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.17 
 
 		 530 aa  340  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1282 aa  335  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  47.06 
 
 		 963 aa  329  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  53.96 
 
 		 1241 aa  327  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  54.73 
 
 		 1300 aa  320  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  54.05 
 
 		 1120 aa  318  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.98 
 
 		 958 aa  318  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  53.53 
 
 		 1969 aa  316  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  50.58 
 
 		 859 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.15 
 
 		 941 aa  315  7.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.79 
 
 		 1230 aa  315  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  41.33 
 
 		 777 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.77 
 
 		 930 aa  310  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.6 
 
 		 1236 aa  305  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.7 
 
 		 460 aa  302  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  49.12 
 
 		 675 aa  299  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  49.14 
 
 		 679 aa  298  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  34.23 
 
 		 801 aa  292  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.65 
 
 		 713 aa  292  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  40.43 
 
 		 819 aa  291  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  50.15 
 
 		 669 aa  290  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.26 
 
 		 786 aa  290  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50.73 
 
 		 861 aa  290  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  48.85 
 
 		 685 aa  287  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.97 
 
 		 658 aa  283  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.41 
 
 		 838 aa  280  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.42 
 
 		 1528 aa  280  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  34.03 
 
 		 812 aa  274  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  42.76 
 
 		 1783 aa  263  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.6 
 
 		 1387 aa  261  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  50.13 
 
 		 1667 aa  258  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.33 
 
 		 840 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.54 
 
 		 1667 aa  241  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.6 
 
 		 1152 aa  240  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.03 
 
 		 615 aa  236  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.37 
 
 		 551 aa  235  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  50.8 
 
 		 547 aa  231  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  49.23 
 
 		 581 aa  225  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  41 
 
 		 791 aa  220  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.97 
 
 		 2176 aa  221  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.53 
 
 		 971 aa  219  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  46.86 
 
 		 910 aa  219  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  46.98 
 
 		 653 aa  219  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 869 aa  218  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  36.3 
 
 		 1814 aa  216  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.83 
 
 		 1011 aa  213  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.01 
 
 		 952 aa  213  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  46.15 
 
 		 682 aa  207  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.98 
 
 		 2552 aa  207  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  31.3 
 
 		 1532 aa  204  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.68 
 
 		 1292 aa  203  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.46 
 
 		 930 aa  203  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  43.15 
 
 		 349 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  44.58 
 
 		 344 aa  200  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  38.31 
 
 		 966 aa  198  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  46.18 
 
 		 361 aa  195  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.44 
 
 		 938 aa  192  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.87 
 
 		 865 aa  191  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  43.51 
 
 		 670 aa  189  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  55.03 
 
 		 184 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.93 
 
 		 929 aa  184  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  51.01 
 
 		 560 aa  183  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  45.22 
 
 		 320 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  44.66 
 
 		 1095 aa  180  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.89 
 
 		 443 aa  180  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  36.18 
 
 		 761 aa  180  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.57 
 
 		 1606 aa  178  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1111 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.01 
 
 		 644 aa  177  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  40.54 
 
 		 276 aa  175  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.15 
 
 		 1620 aa  172  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>