More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1764 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  100 
 
 		 958 aa  1962    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  52.7 
 
 		 869 aa  751    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  49.8 
 
 		 587 aa  475  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  49.38 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  46.74 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.15 
 
 		 752 aa  347  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  43.6 
 
 		 1094 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  44.72 
 
 		 1882 aa  335  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  42.67 
 
 		 1799 aa  334  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  44.72 
 
 		 1682 aa  332  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.27 
 
 		 1842 aa  332  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  44.55 
 
 		 1862 aa  331  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.22 
 
 		 735 aa  327  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1667 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.97 
 
 		 561 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  44.49 
 
 		 978 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.75 
 
 		 575 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.83 
 
 		 963 aa  322  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.98 
 
 		 2554 aa  321  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  42.96 
 
 		 458 aa  320  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.78 
 
 		 1356 aa  320  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.44 
 
 		 2036 aa  319  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  45.5 
 
 		 2000 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  42.09 
 
 		 2122 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.97 
 
 		 2272 aa  307  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1282 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.41 
 
 		 528 aa  303  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  47.49 
 
 		 1667 aa  301  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.43 
 
 		 1361 aa  298  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  40.76 
 
 		 941 aa  298  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  43.61 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.92 
 
 		 930 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  42.77 
 
 		 859 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.76 
 
 		 1300 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.42 
 
 		 838 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  44.65 
 
 		 679 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.78 
 
 		 685 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.05 
 
 		 1120 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  44.04 
 
 		 713 aa  268  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.34 
 
 		 669 aa  265  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  45 
 
 		 675 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  44.88 
 
 		 1969 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.72 
 
 		 930 aa  258  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  37.82 
 
 		 1262 aa  258  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.47 
 
 		 1528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  44.12 
 
 		 1241 aa  251  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.81 
 
 		 658 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  37.71 
 
 		 684 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  43.55 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.87 
 
 		 1236 aa  238  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.09 
 
 		 1387 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  46.06 
 
 		 547 aa  224  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  47.11 
 
 		 581 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  43.58 
 
 		 551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  40.9 
 
 		 861 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.76 
 
 		 1732 aa  212  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.59 
 
 		 3295 aa  211  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.81 
 
 		 791 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  46.77 
 
 		 615 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.7 
 
 		 2176 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  35.51 
 
 		 486 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  37.28 
 
 		 1783 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.41 
 
 		 1011 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  41.28 
 
 		 910 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  46.53 
 
 		 840 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  37.72 
 
 		 1292 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  31.65 
 
 		 550 aa  188  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.3 
 
 		 443 aa  187  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  46.35 
 
 		 719 aa  186  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 		 870 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  35.21 
 
 		 857 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  45.34 
 
 		 845 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  45.92 
 
 		 823 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.96 
 
 		 802 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.3 
 
 		 786 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  45.42 
 
 		 777 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.92 
 
 		 952 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.92 
 
 		 819 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.15 
 
 		 865 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  36.61 
 
 		 1814 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.25 
 
 		 971 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.15 
 
 		 1095 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  52 
 
 		 1056 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.08 
 
 		 1189 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.71 
 
 		 1606 aa  164  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 734 aa  161  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  42.67 
 
 		 2552 aa  156  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.51 
 
 		 560 aa  154  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  38.65 
 
 		 929 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.71 
 
 		 1620 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  46.01 
 
 		 184 aa  151  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 		 519 aa  149  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  43.92 
 
 		 644 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  34.62 
 
 		 938 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.85 
 
 		 1602 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.22 
 
 		 1987 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.76 
 
 		 1531 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  40.72 
 
 		 1231 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  37.21 
 
 		 408 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  26.86 
 
 		 916 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>