More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1978 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 823 aa  1651    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  67.76 
 
 		 719 aa  863    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  66.79 
 
 		 802 aa  957    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  61.25 
 
 		 845 aa  567  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  56.55 
 
 		 840 aa  538  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  72.07 
 
 		 870 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.59 
 
 		 1732 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.43 
 
 		 2554 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  51.74 
 
 		 3295 aa  412  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  78.87 
 
 		 777 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  70.53 
 
 		 786 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  82.16 
 
 		 819 aa  396  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38.73 
 
 		 1380 aa  298  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  87.18 
 
 		 1356 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.77 
 
 		 1387 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40.64 
 
 		 561 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  40.06 
 
 		 859 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.76 
 
 		 735 aa  237  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.29 
 
 		 713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  41.18 
 
 		 669 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40 
 
 		 752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  45.3 
 
 		 930 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.42 
 
 		 1094 aa  234  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.06 
 
 		 2036 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.88 
 
 		 679 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1667 aa  227  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.54 
 
 		 1842 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40 
 
 		 675 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.47 
 
 		 1300 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  40.63 
 
 		 1282 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  40 
 
 		 2122 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  36.64 
 
 		 2272 aa  223  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.58 
 
 		 685 aa  221  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.83 
 
 		 1882 aa  221  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1682 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.12 
 
 		 658 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  35.75 
 
 		 528 aa  213  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.6 
 
 		 1361 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.07 
 
 		 2000 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.63 
 
 		 575 aa  207  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.85 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.08 
 
 		 1120 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  39.13 
 
 		 1241 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  41.67 
 
 		 963 aa  204  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.87 
 
 		 547 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  36.16 
 
 		 1862 aa  204  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  39.89 
 
 		 530 aa  203  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  38.2 
 
 		 978 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.06 
 
 		 1969 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  44.02 
 
 		 581 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  42.15 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.74 
 
 		 791 aa  197  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.94 
 
 		 838 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.91 
 
 		 460 aa  191  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.81 
 
 		 910 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.44 
 
 		 958 aa  188  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.33 
 
 		 930 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.04 
 
 		 1667 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  41.04 
 
 		 615 aa  177  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  33.51 
 
 		 1528 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.93 
 
 		 941 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.24 
 
 		 869 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  47.15 
 
 		 735 aa  157  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  44.59 
 
 		 848 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.96 
 
 		 1236 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  53.15 
 
 		 1234 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.62 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 		 1262 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  37.55 
 
 		 2552 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  40.5 
 
 		 971 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.29 
 
 		 581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  50.61 
 
 		 627 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 1799 aa  149  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.15 
 
 		 1189 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  44.72 
 
 		 644 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.51 
 
 		 184 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.01 
 
 		 952 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  30.1 
 
 		 1292 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  50 
 
 		 954 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 966 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  46.84 
 
 		 522 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  37.86 
 
 		 930 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  34.71 
 
 		 1783 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  67.71 
 
 		 787 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.75 
 
 		 1095 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  36.63 
 
 		 929 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.1 
 
 		 560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.75 
 
 		 1531 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.63 
 
 		 919 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.92 
 
 		 2176 aa  127  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.85 
 
 		 500 aa  127  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  36.59 
 
 		 739 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  50.68 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.92 
 
 		 865 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.68 
 
 		 801 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  39.49 
 
 		 684 aa  125  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  48.59 
 
 		 749 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  43.87 
 
 		 1931 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 875 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  37.31 
 
 		 938 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>