140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1469 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 735 aa  1484    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  61.6 
 
 		 627 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  56.69 
 
 		 919 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  53.09 
 
 		 581 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  50.64 
 
 		 468 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  47.44 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0784  hypothetical protein  32.57 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0425739  unclonable  0.000000000000304005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  48.45 
 
 		 802 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  52.2 
 
 		 954 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  56.38 
 
 		 840 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  56.94 
 
 		 1356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  52.67 
 
 		 1732 aa  165  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  55.41 
 
 		 819 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  48.7 
 
 		 823 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  54.42 
 
 		 845 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  55.78 
 
 		 870 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  54.86 
 
 		 1380 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  53.74 
 
 		 777 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  52 
 
 		 3295 aa  160  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.9 
 
 		 719 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  53.9 
 
 		 786 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  41.55 
 
 		 930 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  51.33 
 
 		 2554 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  52.86 
 
 		 1799 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  48.68 
 
 		 1262 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  47.47 
 
 		 1234 aa  143  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  46.34 
 
 		 522 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 875 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  49.66 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  72.37 
 
 		 668 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  75 
 
 		 387 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  54.76 
 
 		 930 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.33 
 
 		 801 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  67.11 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 		 966 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  62.65 
 
 		 391 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  52.68 
 
 		 958 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  63.38 
 
 		 739 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  65.71 
 
 		 294 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  69.57 
 
 		 831 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  64.86 
 
 		 488 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  58.43 
 
 		 433 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  69.57 
 
 		 676 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  65.75 
 
 		 709 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  53.47 
 
 		 479 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  64.29 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  49.56 
 
 		 1056 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.56 
 
 		 1387 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.29 
 
 		 547 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.33 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  66.67 
 
 		 561 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  64 
 
 		 787 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  62.67 
 
 		 848 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  58.23 
 
 		 361 aa  97.8  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.04 
 
 		 948 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  40.24 
 
 		 627 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  60.56 
 
 		 522 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.3 
 
 		 1004 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  61.76 
 
 		 389 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  62.32 
 
 		 110 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  40.25 
 
 		 982 aa  94.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  57.75 
 
 		 403 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  35.76 
 
 		 918 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 		 1132 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  39.87 
 
 		 798 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  58.82 
 
 		 869 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.41 
 
 		 1024 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  28.91 
 
 		 550 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  40 
 
 		 1338 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.51 
 
 		 933 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.9 
 
 		 1321 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  37.09 
 
 		 461 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  52 
 
 		 390 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  61.43 
 
 		 343 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35.26 
 
 		 500 aa  88.2  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34.38 
 
 		 1295 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  39.23 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  49.43 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  55.56 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.76 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  37.5 
 
 		 1707 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  57.14 
 
 		 697 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  36.69 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.21 
 
 		 972 aa  77.4  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1167 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  48.68 
 
 		 883 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  52.86 
 
 		 884 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  49.18 
 
 		 472 aa  72  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  45.95 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 		 863 aa  69.3  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  47.06 
 
 		 887 aa  68.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  39.08 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  25.44 
 
 		 1091 aa  67  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.7 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  36.61 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.87 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  35.42 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  36.94 
 
 		 639 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  32.48 
 
 		 673 aa  61.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>