More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0675 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 875 aa  1775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  49.61 
 
 		 676 aa  595  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  49.8 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  45.35 
 
 		 400 aa  340  9e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  38.7 
 
 		 471 aa  283  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  31.5 
 
 		 766 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.83 
 
 		 450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  37.87 
 
 		 422 aa  217  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  34.45 
 
 		 748 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  38.81 
 
 		 371 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  40.28 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.57 
 
 		 427 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.28 
 
 		 387 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.5 
 
 		 414 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.32 
 
 		 455 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.24 
 
 		 367 aa  191  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.57 
 
 		 451 aa  189  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.17 
 
 		 396 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.66 
 
 		 388 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.25 
 
 		 403 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.99 
 
 		 460 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.55 
 
 		 461 aa  163  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  29.81 
 
 		 475 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  33.33 
 
 		 2172 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  35.88 
 
 		 419 aa  152  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.61 
 
 		 388 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 468 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.86 
 
 		 392 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  47.89 
 
 		 1234 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 749 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.17 
 
 		 570 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  43.2 
 
 		 1262 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  46.43 
 
 		 735 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 930 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  48.23 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 		 1799 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  32.41 
 
 		 518 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1285  blue (type 1) copper domain protein  58.95 
 
 		 160 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00926842  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 823 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  42 
 
 		 581 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2420  blue (type1) copper domain-containing protein  57.89 
 
 		 159 aa  120  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  41.99 
 
 		 919 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  53.33 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.94 
 
 		 442 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.38 
 
 		 712 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  38.01 
 
 		 966 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 870 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  44 
 
 		 954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.82 
 
 		 845 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 		 777 aa  115  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.6 
 
 		 1387 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 		 1356 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  38.98 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 1380 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41.1 
 
 		 819 aa  111  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.58 
 
 		 2554 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.33 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 719 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 1732 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  33.22 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 840 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.67 
 
 		 520 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  39.16 
 
 		 3295 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  30.94 
 
 		 841 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.03 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.8 
 
 		 488 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  45.75 
 
 		 627 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  30.03 
 
 		 342 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.52 
 
 		 1029 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.14 
 
 		 1657 aa  94  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  34.78 
 
 		 476 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.74 
 
 		 630 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.89 
 
 		 585 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  31.88 
 
 		 476 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  90.5  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 933 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 801 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 526 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 739 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  32.31 
 
 		 476 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  32.75 
 
 		 476 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  31.72 
 
 		 918 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  32.24 
 
 		 999 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  32.24 
 
 		 999 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  28.48 
 
 		 972 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.22 
 
 		 1295 aa  87.8  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.34 
 
 		 999 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  32.17 
 
 		 476 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  36.24 
 
 		 798 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  37.66 
 
 		 524 aa  87.4  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 		 1321 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.38 
 
 		 1338 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.81 
 
 		 729 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  29.01 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  28.73 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>