More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5794 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.21 
 
 		 809 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  56.64 
 
 		 369 aa  318  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  50.56 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  52.91 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  54.3 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  48.88 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  54.04 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  48.45 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  54.52 
 
 		 374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  47.11 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  47.89 
 
 		 369 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  53.92 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  49.46 
 
 		 404 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  46.65 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  49.27 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  49.1 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  43.41 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  47.66 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  48.91 
 
 		 343 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  49.29 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  44.97 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  44.35 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.65 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  47.71 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  47.11 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  44.73 
 
 		 367 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.6 
 
 		 729 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  37.33 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  38.37 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.37 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.83 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.45 
 
 		 407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.75 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.82 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  39.69 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 		 443 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.39 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  37.39 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.46 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  32.22 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.51 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.6 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.01 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  35.56 
 
 		 342 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.26 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.11 
 
 		 585 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  34.8 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.74 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  35.54 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 		 432 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  36.53 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  35.24 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  31.28 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  33.42 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  34.64 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.46 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  31.38 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  33.71 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  36.53 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  34.19 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 530 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.35 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  31.4 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 		 381 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  32.47 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  33.43 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.23 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  34.14 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.21 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>