More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8062 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  68.5 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  65.15 
 
 		 374 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  59.28 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  59.32 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  57.18 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  55.84 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  55.06 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  51.08 
 
 		 404 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  49.25 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  54.04 
 
 		 335 aa  311  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  46.6 
 
 		 405 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  52.8 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  53.92 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  44.71 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.13 
 
 		 809 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  49.29 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  44.01 
 
 		 394 aa  281  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  46.65 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  51.21 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  48.28 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.69 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  48.96 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  46.73 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  39.51 
 
 		 394 aa  245  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.96 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.68 
 
 		 729 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.52 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  41.74 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.77 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  38.97 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  40.36 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  38.44 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.55 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.87 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38.87 
 
 		 385 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  39.11 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  34.17 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.89 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  38.01 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.87 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.06 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  36.51 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  37.46 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 		 430 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36.45 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  32.54 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.46 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  36.76 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.4 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  37.76 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  36.96 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  37.01 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.56 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.85 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  35.01 
 
 		 381 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 407 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  33.78 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32.24 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  31.32 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.43 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.48 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  35.88 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.61 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.98 
 
 		 530 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.39 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  32.72 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  37.13 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  36.51 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  32.82 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  30.23 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  34.82 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  34.35 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.49 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  28.24 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>