286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2732 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
442 aa  843    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  54.27 
 
 
401 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  50.47 
 
 
407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  53.79 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  52 
 
 
381 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  49.87 
 
 
398 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  43.55 
 
 
394 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  50 
 
 
360 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  52.14 
 
 
399 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  48.16 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  49.01 
 
 
369 aa  270  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  45.24 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  49.43 
 
 
388 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  48.47 
 
 
369 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  48.72 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  46.57 
 
 
353 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  43.47 
 
 
389 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  45.98 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  45.14 
 
 
343 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.48 
 
 
809 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  50.99 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  41.04 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  39.31 
 
 
394 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  35.35 
 
 
381 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.05 
 
 
369 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 
360 aa  196  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  39.44 
 
 
388 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.98 
 
 
729 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  37.72 
 
 
363 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  38.02 
 
 
367 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.62 
 
 
385 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 
385 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.32 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 
410 aa  163  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  39.38 
 
 
443 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 
366 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  32.85 
 
 
407 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.58 
 
 
365 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 
377 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
390 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 
387 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  35.37 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  37.02 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  32.17 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  34 
 
 
377 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.74 
 
 
387 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  34.9 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  36.8 
 
 
392 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  33.42 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  34.52 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  35.01 
 
 
469 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  34.32 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 
381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  32.33 
 
 
387 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.88 
 
 
399 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 
413 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.11 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.35 
 
 
383 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.68 
 
 
388 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 
383 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  31.86 
 
 
373 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  31.32 
 
 
372 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
432 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
395 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 
387 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 
408 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 
360 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.23 
 
 
405 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 
379 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
366 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.83 
 
 
388 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.57 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  33.58 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  32.78 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  36.1 
 
 
530 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.79 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
402 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28.76 
 
 
392 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.54 
 
 
412 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 
374 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>