More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1561 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  736    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  42.17 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  43.54 
 
 		 410 aa  239  8e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  37.46 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  38.89 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.25 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  38.25 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  36.8 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  38.84 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  37.2 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  40.96 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.31 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.27 
 
 		 809 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.45 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  37.72 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  34.23 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  35.13 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  36.02 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  33.75 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  35.28 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  36.23 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  38.13 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  39.03 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.27 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.52 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38.41 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  33.13 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  31.37 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 395 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  30.83 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  32.87 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  35.61 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.11 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  31.46 
 
 		 469 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 388 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 413 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  29.7 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  29.79 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  32.26 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.36 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.43 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  32.55 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  31.11 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.81 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  28.95 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  32.74 
 
 		 411 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  30.67 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.11 
 
 		 729 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  30.22 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  31.96 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  29.29 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  28.12 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>