More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4374 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  683    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  50.99 
 
 
357 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  54.63 
 
 
381 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  51.36 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  51.27 
 
 
398 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  50.16 
 
 
369 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  50.16 
 
 
406 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  49.36 
 
 
360 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  48.73 
 
 
374 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  50.83 
 
 
388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  47.17 
 
 
381 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  47.46 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.32 
 
 
809 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  47.52 
 
 
399 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  47.77 
 
 
401 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  49.84 
 
 
407 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 
377 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  46.01 
 
 
335 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  45.45 
 
 
389 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  49.04 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  46.11 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  44.92 
 
 
388 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  46.88 
 
 
353 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  41.38 
 
 
394 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  45.14 
 
 
442 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.07 
 
 
369 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.24 
 
 
729 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  43.83 
 
 
367 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  39.82 
 
 
408 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  38.46 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  40.89 
 
 
363 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.12 
 
 
365 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.39 
 
 
385 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.23 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38.23 
 
 
385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 
360 aa  173  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  34.31 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  36.2 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  36.76 
 
 
387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.86 
 
 
407 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.48 
 
 
392 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 
375 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 
395 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 
443 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 
366 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 
374 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 
374 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 
395 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  32.12 
 
 
387 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 
378 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 
469 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  35.16 
 
 
378 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 
390 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  32.06 
 
 
382 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.59 
 
 
400 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  35.88 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.94 
 
 
391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  32.65 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  33.14 
 
 
389 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  34.97 
 
 
411 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
381 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  31.52 
 
 
387 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.82 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.62 
 
 
1657 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  34.36 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  33.12 
 
 
377 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  32.51 
 
 
400 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  32.73 
 
 
386 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  32.18 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.88 
 
 
585 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  30.47 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  32.37 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.42 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  31.32 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  35.29 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  31.87 
 
 
405 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 
430 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  33.43 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
387 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.01 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.46 
 
 
406 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 
428 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>