More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2870 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  837    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  52.94 
 
 
385 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  52.38 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  52.66 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  43.64 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  46.45 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.86 
 
 
369 aa  262  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.45 
 
 
360 aa  239  9e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 
410 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  41.03 
 
 
381 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  37.46 
 
 
363 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  40.88 
 
 
369 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 
389 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  36.15 
 
 
376 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 
381 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  39.17 
 
 
360 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  40.11 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  40.35 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  38.99 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.92 
 
 
382 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  41.11 
 
 
399 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  38.08 
 
 
369 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.29 
 
 
809 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.86 
 
 
407 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.68 
 
 
374 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.17 
 
 
430 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 
395 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.9 
 
 
374 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
418 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  33.49 
 
 
405 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  35.02 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
375 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  39.05 
 
 
343 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  37.21 
 
 
398 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 
395 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  32.85 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  38.03 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.36 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  35.18 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 
392 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 
469 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 
443 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  36 
 
 
383 aa  179  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 
428 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  36.17 
 
 
377 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  37.01 
 
 
353 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 
428 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 
370 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  34.78 
 
 
410 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 
396 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 
391 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 
432 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  35.8 
 
 
383 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.79 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  31.75 
 
 
387 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  34.56 
 
 
378 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 
413 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
377 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 
392 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 
382 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 
399 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  34.23 
 
 
376 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  34.96 
 
 
382 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  36.44 
 
 
404 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.99 
 
 
389 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 
386 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 
400 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  34.2 
 
 
376 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  34.12 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  34.97 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 
375 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 
408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.82 
 
 
381 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 
397 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  31.93 
 
 
406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  32.65 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.12 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.23 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
372 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 
388 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 
381 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 
391 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.85 
 
 
366 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  32.76 
 
 
442 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
381 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
465 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  30.92 
 
 
388 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 
391 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.09 
 
 
400 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 
407 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 
394 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>