268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2329 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  929    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  42.35 
 
 
443 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  35.57 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.05 
 
 
369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  34.63 
 
 
408 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  37.11 
 
 
367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  39.43 
 
 
385 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  32.3 
 
 
410 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  39.79 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  39.16 
 
 
385 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  37.34 
 
 
385 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.66 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  34 
 
 
369 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.81 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.89 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  33.76 
 
 
366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.11 
 
 
365 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  32.15 
 
 
381 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  36.15 
 
 
369 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.17 
 
 
376 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 
406 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
430 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.16 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 
353 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  30.17 
 
 
394 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  36.01 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  32.74 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 
418 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  33.68 
 
 
343 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
374 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.65 
 
 
809 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 
428 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 
428 aa  143  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  31.96 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 
388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 
375 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 
391 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.95 
 
 
374 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 
391 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 
389 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 
374 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  27.67 
 
 
392 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 
432 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
382 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 
410 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 
387 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 
375 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 
395 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  30.28 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  29.18 
 
 
374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  28.12 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 
395 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 
386 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  28.3 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  30.47 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 
388 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
359 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.79 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  28.31 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  31.68 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 
400 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  29.7 
 
 
382 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.74 
 
 
377 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.94 
 
 
389 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.55 
 
 
366 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  29.2 
 
 
381 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  27.47 
 
 
384 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  27.27 
 
 
358 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
406 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 
381 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  30.69 
 
 
384 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 
377 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  28.32 
 
 
376 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 
408 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.14 
 
 
383 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  29.8 
 
 
411 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  30.94 
 
 
392 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  27.85 
 
 
383 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 
412 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 
406 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
462 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 
370 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
399 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 
390 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>