More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3368 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  64.13 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  51.29 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  50.15 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  50.46 
 
 		 398 aa  291  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  47.73 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  49.08 
 
 		 388 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  49.22 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  47.73 
 
 		 442 aa  278  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  47.73 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  45.88 
 
 		 374 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  46.49 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  47.22 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  45.51 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  46.15 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  47.69 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  43.54 
 
 		 405 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  39.63 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  45.17 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.86 
 
 		 809 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  46.2 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  46.88 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  41.79 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  43.53 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.49 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  48.18 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  35.36 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  42.69 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  38.19 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.8 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.93 
 
 		 729 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  38.69 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  38.12 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  35.44 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  37.87 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.78 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  32.98 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.91 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.31 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 466 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.83 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.68 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  32.51 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  29.74 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  29.47 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  31.04 
 
 		 530 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28.23 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  32.16 
 
 		 370 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.11 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  30.16 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.33 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  29.33 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  31.77 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.02 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.47 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  33.13 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.59 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.21 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  36.45 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.93 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.03 
 
 		 394 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  30.48 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  31.94 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.53 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  32.37 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  32.1 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  31.01 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.01 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>