216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1463 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 407 aa  798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  42.89 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.64 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  40.1 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  38.72 
 
 		 369 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  38.66 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  39.13 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  40.45 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  39.12 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  39.64 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  39.7 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  39.55 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  36.86 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.06 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  39.81 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  39.94 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  39.94 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  39.94 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  38.31 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  39.77 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  35.87 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  38.55 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.97 
 
 		 809 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  36.57 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.35 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  35.99 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  36.12 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  35.46 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.83 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  33 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 		 369 aa  136  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  35.09 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.83 
 
 		 729 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  30.96 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.16 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  26.4 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.24 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  38.12 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.84 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  33.77 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  27.68 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1958  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.64 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.922706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  25.35 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  34.78 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  28.82 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  29.54 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  25.71 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  31.98 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  27.03 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.19 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.72 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.83 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  29.31 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  25.66 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  27.1 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.97 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.45 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.38 
 
 		 1657 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  31.47 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  28.82 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  25.56 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  30.29 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  28.63 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>