More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1186 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  65.94 
 
 
376 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  53.89 
 
 
387 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  47.06 
 
 
408 aa  348  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  51.41 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  47.09 
 
 
407 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  48.85 
 
 
388 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  47.07 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  46.03 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  48.42 
 
 
377 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  44.31 
 
 
415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  47.84 
 
 
377 aa  306  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  46.59 
 
 
377 aa  300  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  42.01 
 
 
394 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  44.48 
 
 
410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  45.17 
 
 
432 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  44.93 
 
 
428 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  44.64 
 
 
428 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  44.6 
 
 
387 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  40.56 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  42.63 
 
 
387 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  44.13 
 
 
392 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  41.91 
 
 
388 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  45 
 
 
387 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  40.1 
 
 
374 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  40.67 
 
 
383 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  39.84 
 
 
378 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  39.84 
 
 
374 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  38.32 
 
 
382 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  41.22 
 
 
370 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  37.89 
 
 
400 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  40.35 
 
 
375 aa  255  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  39.79 
 
 
396 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  40.1 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  38.48 
 
 
406 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  37.21 
 
 
392 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  40.8 
 
 
382 aa  248  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  42.14 
 
 
399 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  39.09 
 
 
397 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  38.74 
 
 
400 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  41.64 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 
375 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  41.19 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  41.34 
 
 
406 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 
388 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  38.11 
 
 
430 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  39.9 
 
 
397 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  41.49 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  41.52 
 
 
403 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  38.46 
 
 
391 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  39.26 
 
 
389 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  42.29 
 
 
402 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  39.89 
 
 
366 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  41.67 
 
 
379 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  38.28 
 
 
466 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  39.61 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  37.85 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  38.75 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  39.53 
 
 
388 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.78 
 
 
391 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  40.17 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  40.29 
 
 
386 aa  232  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  38.57 
 
 
418 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  41.69 
 
 
380 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  38.05 
 
 
387 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  37.79 
 
 
387 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  39.82 
 
 
394 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  39.5 
 
 
395 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 
395 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  41.37 
 
 
381 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  39.6 
 
 
360 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  39.94 
 
 
407 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  39.1 
 
 
368 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  40.23 
 
 
384 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 
412 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  40.66 
 
 
394 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  38.59 
 
 
377 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  37.69 
 
 
392 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  38.59 
 
 
381 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  40.11 
 
 
396 aa  226  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  40.46 
 
 
396 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 
383 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  41.07 
 
 
381 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  35.53 
 
 
395 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 
413 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  38.29 
 
 
383 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  38.42 
 
 
374 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  36.76 
 
 
373 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  39.12 
 
 
382 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  36.75 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  36.31 
 
 
485 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  39.6 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  38.32 
 
 
369 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  36.23 
 
 
392 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 
377 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  37.91 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  37.54 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  36.22 
 
 
530 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  37.37 
 
 
386 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>