More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0163 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  77.18 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  37.99 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  39 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  37.85 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  35.63 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  38.7 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.9 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  35.24 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  34.46 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  36.03 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  33.66 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  34.96 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  37.28 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.48 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  31.93 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.99 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  33.77 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.93 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  34.23 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.22 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  37.01 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.57 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  35.63 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 392 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  36.41 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.9 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.98 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  33.03 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  35.51 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  31.96 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  31.96 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.45 
 
 		 388 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  31.96 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.89 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  31.96 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  31.96 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  33.25 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  34.92 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.05 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  36.1 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  32.1 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.17 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.57 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  31.68 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  30.73 
 
 		 371 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  30.73 
 
 		 371 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.9 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  32.67 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  32.32 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.36 
 
 		 365 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.51 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  32.99 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  35.38 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.43 
 
 		 729 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  32.27 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.87 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.4 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 		 530 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.88 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.1 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.09 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  34.78 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  33.87 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  34.81 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  32.49 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>