More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3392 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  982    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  42.74 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  39.27 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  35.74 
 
 		 530 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  43.31 
 
 		 392 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  39.78 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  40.75 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  42.15 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  40.44 
 
 		 387 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  38.93 
 
 		 376 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  38.59 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  40.29 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  40.17 
 
 		 382 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  38.06 
 
 		 384 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  41.21 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  36.82 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  39.26 
 
 		 400 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  37.33 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  39.08 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  39.26 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  37.33 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  39.02 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  36.89 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  39.9 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  37.57 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  37.02 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  36.83 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  37.61 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  37.95 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  37.46 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  35.56 
 
 		 381 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 		 360 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  38.79 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  35.01 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  39.02 
 
 		 383 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  35.97 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  39.19 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  35.49 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.25 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  36.77 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  39.49 
 
 		 381 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  39.49 
 
 		 381 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.91 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  39.17 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  37.76 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.54 
 
 		 371 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  36.54 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  38.27 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  36.03 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.54 
 
 		 371 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  37.26 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  35.78 
 
 		 378 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  36.31 
 
 		 386 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  38.55 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  37.28 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  35.51 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 391 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  34.44 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  34.91 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 		 374 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  32.55 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  37.98 
 
 		 405 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.01 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  35 
 
 		 368 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  35.13 
 
 		 372 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  34.16 
 
 		 374 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  34.07 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  37.22 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 359 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>