263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001471 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  100 
 
 		 358 aa  742    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  88.24 
 
 		 358 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  56.13 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  48.4 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  48.63 
 
 		 374 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  42.41 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  39.25 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  39.11 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  36.97 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  38.27 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  39.61 
 
 		 405 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  37.15 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  39.61 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  37.28 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  37.9 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  38.16 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  38.46 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  38.87 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  37.25 
 
 		 392 aa  238  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  39.66 
 
 		 386 aa  238  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.13 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  38.13 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  37.29 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.94 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  38.03 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  36.93 
 
 		 430 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  39.14 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  38.86 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  35.2 
 
 		 400 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  35.41 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  35.13 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  36.03 
 
 		 418 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.28 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.55 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  38.6 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  38.06 
 
 		 395 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  36.49 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  36.49 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  34.25 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  35.84 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  34.53 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  36.64 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  36.64 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.64 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.64 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.64 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.64 
 
 		 371 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  36.51 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.36 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  36.36 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  35.24 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  35.73 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  35.04 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  34.79 
 
 		 369 aa  212  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  36.26 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  36.47 
 
 		 382 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  36.8 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  34.94 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  35.5 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  35.69 
 
 		 383 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  34.94 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  38.65 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 405 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  37.22 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.47 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  35.29 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 415 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  34.86 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 		 408 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  35.54 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 397 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  34.79 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  34.21 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  32.94 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  34.99 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  35.86 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>