More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4955 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  868    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  93.29 
 
 
428 aa  819    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  93.52 
 
 
428 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  68.35 
 
 
402 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  52.96 
 
 
410 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  55.05 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  53.51 
 
 
394 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  54.78 
 
 
399 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  52.08 
 
 
403 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  49.35 
 
 
407 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  49.33 
 
 
413 aa  364  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  52.39 
 
 
387 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.63 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  51.98 
 
 
392 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  51.98 
 
 
381 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  51.98 
 
 
381 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  50.83 
 
 
391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  48.79 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  48.13 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  48.51 
 
 
400 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  48.29 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  51.59 
 
 
388 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  47.15 
 
 
395 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  50.42 
 
 
383 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  50.56 
 
 
382 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  49.72 
 
 
360 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  46.93 
 
 
408 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  50.27 
 
 
378 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  49.6 
 
 
405 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  48.48 
 
 
400 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  51.02 
 
 
378 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  51.44 
 
 
381 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  45.97 
 
 
394 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  50.29 
 
 
387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  48.52 
 
 
387 aa  329  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  49.45 
 
 
391 aa  328  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  48.85 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  45.14 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  50.14 
 
 
382 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  44.77 
 
 
392 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  47.44 
 
 
387 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  49.71 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  49.58 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  44.5 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  47.84 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  49.7 
 
 
387 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  48.73 
 
 
396 aa  319  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  46.7 
 
 
388 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  48.44 
 
 
396 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  45.27 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  48.27 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  45.45 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  42.82 
 
 
418 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  44.81 
 
 
374 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  47.13 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  44.26 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  45.48 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  43.32 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  46.13 
 
 
368 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  49.43 
 
 
406 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  44.13 
 
 
370 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  45.63 
 
 
373 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  43.45 
 
 
369 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  41.25 
 
 
465 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  40.75 
 
 
395 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  41.88 
 
 
375 aa  296  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  48.3 
 
 
378 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  45.3 
 
 
380 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  41.03 
 
 
395 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  44.19 
 
 
384 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  44.6 
 
 
371 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  44.26 
 
 
371 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  44.26 
 
 
371 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  44.6 
 
 
371 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  44.6 
 
 
371 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  44.6 
 
 
371 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  44.38 
 
 
379 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  44.32 
 
 
371 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  44.32 
 
 
371 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  43.62 
 
 
377 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  45.17 
 
 
372 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  45.17 
 
 
382 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  43.59 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  44.35 
 
 
392 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  43.77 
 
 
387 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  42.74 
 
 
396 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  42.98 
 
 
388 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  43.17 
 
 
404 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  42.37 
 
 
376 aa  279  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  43.19 
 
 
466 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  45.4 
 
 
369 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  42.01 
 
 
379 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  43.94 
 
 
376 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  39.28 
 
 
366 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  40.75 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  41.39 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  42.6 
 
 
407 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  41.79 
 
 
377 aa  269  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  44.02 
 
 
377 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>