281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3539 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  98.43 
 
 		 381 aa  757    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  94.72 
 
 		 383 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  91.32 
 
 		 382 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 381 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  71.65 
 
 		 387 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  72.89 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  70.28 
 
 		 387 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  74.58 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  73.65 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  69.21 
 
 		 378 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  70.45 
 
 		 381 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  68.22 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  68.22 
 
 		 388 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  59.89 
 
 		 373 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  64.81 
 
 		 372 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  63.48 
 
 		 374 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  60.33 
 
 		 371 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  59.3 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  60.06 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  59.3 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  60.06 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  60.06 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  60.06 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  55.1 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  51.6 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  53.91 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  52.13 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  51.34 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  52.72 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  52.19 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  53.26 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  51.98 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  48.52 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  51.13 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  52.02 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  50.85 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  53.82 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  49.44 
 
 		 376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  52.79 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  48.34 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  48.34 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  49.29 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  48.34 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  48.34 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  49.1 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  47.68 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  48.15 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  46.92 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  48.15 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  47.2 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  46.93 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  44.85 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  48.27 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  47.75 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  49.57 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  49.1 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 391 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  48.56 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  44.99 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  49.42 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  46.97 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  46.2 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  49.3 
 
 		 402 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  42.32 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  47.71 
 
 		 384 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.48 
 
 		 412 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  48.31 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  44.05 
 
 		 368 aa  289  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  45.78 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  46.72 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  44.22 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  42.16 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  44.74 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  43.97 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  44.57 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  46.22 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  43.73 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  43.73 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  43.53 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  42.15 
 
 		 404 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  41.53 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  41.9 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  43.31 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  42.49 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  41.11 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  41.22 
 
 		 377 aa  265  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  42.29 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  40.43 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  42.29 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  39.4 
 
 		 405 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  41.64 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  41.58 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  42.77 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  40.31 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  44.51 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  40.17 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  39.68 
 
 		 407 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>