More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1715 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  804    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  98.92 
 
 
369 aa  748    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  49.85 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  46.73 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  43.67 
 
 
410 aa  270  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  46.45 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  42.57 
 
 
389 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  44.97 
 
 
388 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.89 
 
 
809 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  43.44 
 
 
360 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.95 
 
 
407 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  44.24 
 
 
406 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  43.57 
 
 
394 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  42.44 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  41.79 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  41.72 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  41.38 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  43.43 
 
 
399 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  43.48 
 
 
374 aa  229  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  38.21 
 
 
381 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  41.27 
 
 
369 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  41.61 
 
 
357 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  41.41 
 
 
369 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  38.89 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  39.69 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  38.32 
 
 
377 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  37.22 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  40.43 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  38.07 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  38.05 
 
 
335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  39.77 
 
 
385 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  40.29 
 
 
385 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 
385 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  40.5 
 
 
404 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  39.31 
 
 
442 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.07 
 
 
365 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.6 
 
 
729 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 
469 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  37.94 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  32.68 
 
 
443 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.72 
 
 
376 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 
430 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.2 
 
 
399 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.03 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.67 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 
388 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 
377 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  35.78 
 
 
396 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 
395 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.68 
 
 
387 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  33.87 
 
 
379 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
395 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  36.21 
 
 
411 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
383 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
405 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  35.04 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  33.78 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.57 
 
 
387 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  30.79 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  32.71 
 
 
374 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.13 
 
 
392 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 
432 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 
374 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  35.78 
 
 
381 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 
382 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 
360 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  33.9 
 
 
388 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 
387 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
466 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  33.64 
 
 
368 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  34.92 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  32.55 
 
 
391 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  31.54 
 
 
377 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.32 
 
 
387 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.98 
 
 
374 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
392 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
383 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
406 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 
386 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  33.71 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  34.5 
 
 
377 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  32.74 
 
 
392 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
382 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.73 
 
 
378 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  31.14 
 
 
394 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  38.43 
 
 
530 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 
375 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  31.96 
 
 
382 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 
410 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
375 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 
388 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 
374 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>