274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2919 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  100 
 
 		 365 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.12 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  37.38 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  33.07 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.99 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.99 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  34.91 
 
 		 406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.71 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.18 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  35.53 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.99 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  35.53 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  35.61 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  32.33 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.83 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 466 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  31.91 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.43 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.43 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  32.68 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.8 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  35.8 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  36.45 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.82 
 
 		 729 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  33.13 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  32.64 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  36.2 
 
 		 369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.54 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.72 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  31.3 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  34.53 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.28 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  33.13 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.83 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 		 530 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  31.37 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  35.09 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.66 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.53 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  29.35 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.86 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  30.31 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.23 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 		 430 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  32.34 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.76 
 
 		 432 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  34.95 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  35.06 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  30.95 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 		 465 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  31.97 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.16 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  32.62 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  35 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.78 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  31.75 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  31.71 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  32.49 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  31.14 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  31.14 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  31.95 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>