283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  777    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  55.68 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  56.97 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  49.67 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  55.88 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  54.04 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  51.08 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  47.89 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  43.42 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  52.54 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  52 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  46.46 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  51.21 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  46.49 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  43.69 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  49.39 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  48.7 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.87 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  47.69 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  43.95 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 		 809 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.63 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  41.57 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  44.51 
 
 		 335 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  43.33 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  44.67 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.32 
 
 		 729 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  43.15 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 360 aa  206  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  37.86 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  36.67 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 410 aa  176  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.23 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  36.23 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  39.22 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.19 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  35.35 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  34.32 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.06 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  36.71 
 
 		 381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  37.03 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.64 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  34.57 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  37.39 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.51 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.39 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  36.13 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  36.03 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.59 
 
 		 374 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.12 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  35.26 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  36.92 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.4 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.2 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.87 
 
 		 383 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  36.92 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  34.09 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 		 376 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  32.19 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  32.55 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  36.16 
 
 		 386 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.35 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  32.5 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  32.56 
 
 		 388 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  34.03 
 
 		 377 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  34.17 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  35.49 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  30.57 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  34.72 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.99 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>