278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2304 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  867    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  42.56 
 
 
469 aa  299  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
360 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  37.05 
 
 
367 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.68 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  35 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.94 
 
 
408 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.43 
 
 
369 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38 
 
 
404 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  37.88 
 
 
401 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  38.12 
 
 
353 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.64 
 
 
398 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.06 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  36.03 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.2 
 
 
360 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
357 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  34.11 
 
 
369 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 
405 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 
374 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  35.94 
 
 
369 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  39.69 
 
 
442 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.9 
 
 
385 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 
389 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  33.66 
 
 
385 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 
407 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  33.94 
 
 
394 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  33.25 
 
 
366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.11 
 
 
809 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  37.05 
 
 
399 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 
385 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 
363 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  35.34 
 
 
377 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.7 
 
 
392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 
335 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.6 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  33.42 
 
 
388 aa  133  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 
382 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  30.1 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
410 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 
381 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.82 
 
 
430 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 
381 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 
381 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 
407 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 
374 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.71 
 
 
383 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
382 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  29.9 
 
 
377 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.05 
 
 
389 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.83 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  31.28 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 
374 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 
432 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 
374 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  26.88 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  30.69 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.24 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  28.72 
 
 
383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  30.27 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.78 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
377 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
378 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 
407 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 
530 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  30.21 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 
391 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 
375 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 
391 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  27.86 
 
 
387 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  29.4 
 
 
382 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  30.77 
 
 
382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  32.53 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.79 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  31.04 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  29.05 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  30.23 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.45 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  29.8 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 
406 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  30.43 
 
 
373 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>