More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1322 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  50.77 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  52.85 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  54.45 
 
 		 404 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  53.93 
 
 		 369 aa  318  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  54.66 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  55.25 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  52.03 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  49.26 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  53.33 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.55 
 
 		 809 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  47.03 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  47.93 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  46.42 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  47.87 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  46.7 
 
 		 369 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  50.78 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  44 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.48 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  46.85 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  38.5 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  45.4 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.15 
 
 		 729 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  45.27 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  49.19 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  43.53 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.9 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  45.62 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  37.17 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  36.54 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  38 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  37.85 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.21 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  40.71 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  41.37 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  40.27 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  38.93 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  37.2 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  36.45 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  36.81 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  38.37 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  36.09 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  31.93 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  38.12 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.55 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  35.55 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.95 
 
 		 530 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  36.42 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  36.04 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  35.2 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.98 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.82 
 
 		 387 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  33.18 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.44 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.54 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.17 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  36.15 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  31.06 
 
 		 466 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  34.56 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  35.71 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  33.83 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  34.24 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  36.42 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  35.98 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  35.65 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  30.13 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  33.83 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  32.54 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.67 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 		 428 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  32.84 
 
 		 406 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  34.61 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>