258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0846 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  40.99 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  39.69 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 
410 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.75 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 
360 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  37.31 
 
 
389 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38.68 
 
 
404 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  38.34 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  36.63 
 
 
394 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  39.69 
 
 
388 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 
407 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  38.01 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  37.23 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.39 
 
 
809 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  36.91 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 
406 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
382 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 
374 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  35.67 
 
 
357 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  34.31 
 
 
343 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  37.55 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 
469 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  33.25 
 
 
443 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  35.91 
 
 
399 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 
442 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  36.76 
 
 
388 aa  149  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.04 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  32.64 
 
 
408 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  34.71 
 
 
405 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 
377 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.56 
 
 
365 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  33.79 
 
 
375 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  34.88 
 
 
384 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  33.94 
 
 
384 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
396 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
368 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  37.83 
 
 
358 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 
376 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  29.75 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  36.51 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 
376 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.71 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.78 
 
 
729 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 
466 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 
380 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.61 
 
 
585 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32.35 
 
 
386 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
428 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
428 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 
377 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  28.66 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 
387 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 
375 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 
395 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
391 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 
400 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.62 
 
 
388 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
390 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 
374 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 
400 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  31.4 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.35 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 
388 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 
406 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  34.58 
 
 
388 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  31.27 
 
 
387 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.74 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.09 
 
 
342 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.31 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.13 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 
413 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.2 
 
 
366 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
391 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  33.91 
 
 
405 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.46 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  35.29 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.66 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  35.19 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  31.41 
 
 
391 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>