More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0509 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  91.94 
 
 
385 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  91.94 
 
 
385 aa  646    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  52.38 
 
 
408 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  42.66 
 
 
367 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  41.33 
 
 
381 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  40.06 
 
 
394 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  40 
 
 
369 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  38.12 
 
 
410 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  39.18 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  40.36 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.78 
 
 
360 aa  196  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 
375 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  38.07 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 
389 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  38.4 
 
 
405 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  37.24 
 
 
398 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  37.57 
 
 
369 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  36.8 
 
 
406 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 
396 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  35.59 
 
 
418 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  40.33 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  38.82 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.04 
 
 
382 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.2 
 
 
376 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  31.92 
 
 
395 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  38.62 
 
 
442 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  40.12 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  38.77 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  38.18 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.38 
 
 
809 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 
469 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.64 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.37 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.55 
 
 
394 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  36.47 
 
 
376 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.3 
 
 
374 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.22 
 
 
407 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  33.15 
 
 
411 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.49 
 
 
374 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 
353 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
380 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  36.18 
 
 
366 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 
370 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 
379 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  37.61 
 
 
377 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  34.77 
 
 
369 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 
376 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 
430 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  38.39 
 
 
343 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 
383 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  39.16 
 
 
404 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 
357 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.77 
 
 
396 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 
387 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
386 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 
399 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  34.39 
 
 
382 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  35.47 
 
 
387 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.47 
 
 
388 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.45 
 
 
365 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 
378 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  34.87 
 
 
335 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 
388 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  34.5 
 
 
465 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 
400 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  31.74 
 
 
360 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  35.8 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.66 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  34.94 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  32.49 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
379 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
397 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  33.7 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 
410 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  35.13 
 
 
391 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.16 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.2 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 
406 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
408 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  31.11 
 
 
392 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 
377 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  32.76 
 
 
384 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  30.97 
 
 
403 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
428 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 
391 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 
394 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.2 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  32.17 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 
390 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  30.33 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>