More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0538 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  91.94 
 
 
385 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  99.48 
 
 
385 aa  739    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  52.66 
 
 
408 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  42.94 
 
 
367 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  38.28 
 
 
394 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.76 
 
 
369 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  37.9 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  40.57 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  38.26 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 
360 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  38.61 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  38.83 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.87 
 
 
375 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  39.1 
 
 
360 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  37.71 
 
 
374 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  37.86 
 
 
398 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 
418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.81 
 
 
809 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
396 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 
389 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  40.38 
 
 
401 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  38.64 
 
 
469 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  35.73 
 
 
406 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  37.39 
 
 
388 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  38.77 
 
 
388 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  33.91 
 
 
376 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  36.22 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  39.28 
 
 
399 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  36.1 
 
 
376 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 
394 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  37.27 
 
 
377 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 
379 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.91 
 
 
395 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  36.31 
 
 
343 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.11 
 
 
366 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.73 
 
 
370 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  35.61 
 
 
353 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  34.08 
 
 
411 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
443 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
430 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 
374 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.77 
 
 
383 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 
380 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.75 
 
 
374 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 
381 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  39.16 
 
 
404 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  34.88 
 
 
357 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 
396 aa  150  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 
388 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.96 
 
 
387 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  32.4 
 
 
377 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  34.68 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.81 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  35.73 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 
378 aa  146  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.23 
 
 
399 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
387 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  34.64 
 
 
378 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 
465 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.75 
 
 
389 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 
410 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  34.38 
 
 
386 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  35.36 
 
 
335 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.28 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.56 
 
 
391 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.93 
 
 
428 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 
368 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.26 
 
 
391 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 
428 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  31.54 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.01 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  31.03 
 
 
392 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.27 
 
 
365 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.94 
 
 
388 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 
394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 
379 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  31.97 
 
 
377 aa  135  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 
377 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 
388 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 
394 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  32.3 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  28.72 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  32.37 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.48 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  28.29 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  28.29 
 
 
400 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.28 
 
 
381 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>