283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3428 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  60.06 
 
 
360 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  52.97 
 
 
406 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  49.22 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  51.54 
 
 
369 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  53.7 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  45.99 
 
 
405 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  48.3 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  52.45 
 
 
398 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  50.94 
 
 
388 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  48.06 
 
 
404 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.62 
 
 
809 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  49.45 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  47.91 
 
 
401 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  44.53 
 
 
394 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  40.82 
 
 
381 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  42.57 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  47 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  43.54 
 
 
442 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.27 
 
 
369 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  46.08 
 
 
335 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  48 
 
 
388 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  47.48 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  45.7 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  42.73 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  43.61 
 
 
353 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  45.45 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41 
 
 
729 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.1 
 
 
408 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  39.29 
 
 
360 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  38.46 
 
 
387 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.99 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.31 
 
 
366 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  39.19 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  34.83 
 
 
363 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.39 
 
 
382 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 
385 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 
385 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  36.21 
 
 
381 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  36.44 
 
 
381 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  37.86 
 
 
384 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  36.26 
 
 
383 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 
418 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  33.78 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 
430 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  37.2 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.78 
 
 
365 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
432 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 
407 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  35.44 
 
 
394 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 
382 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  35.88 
 
 
396 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 
443 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 
403 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.03 
 
 
374 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 
396 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.28 
 
 
374 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.95 
 
 
400 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.47 
 
 
383 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 
413 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  34.47 
 
 
395 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.42 
 
 
407 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  35.09 
 
 
387 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
392 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.76 
 
 
389 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  33.24 
 
 
382 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.87 
 
 
391 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.07 
 
 
412 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
397 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
406 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 
378 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.31 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  34.96 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 
388 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 
376 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  32.73 
 
 
407 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  33.9 
 
 
397 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  33.92 
 
 
360 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  36.47 
 
 
377 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 
377 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  35.8 
 
 
375 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 
391 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 
391 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.68 
 
 
405 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  32.04 
 
 
387 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.12 
 
 
366 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  34.49 
 
 
381 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.41 
 
 
392 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  32.25 
 
 
388 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>