288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0965 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  777    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  54.6 
 
 
401 aa  329  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  56.02 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  52.91 
 
 
374 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  55.07 
 
 
406 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  54.66 
 
 
360 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  56.97 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  58.36 
 
 
399 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  53.03 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  53.79 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  47.41 
 
 
394 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  48.03 
 
 
389 aa  292  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  47.41 
 
 
398 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  51.83 
 
 
388 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  47.78 
 
 
369 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  45.93 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  47.08 
 
 
335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  47.97 
 
 
353 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.54 
 
 
809 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  46.15 
 
 
388 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  38.22 
 
 
381 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  48.56 
 
 
377 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.12 
 
 
343 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  42.59 
 
 
357 aa  219  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  40.5 
 
 
394 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  39.88 
 
 
369 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  40.71 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.25 
 
 
729 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  39.04 
 
 
367 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  39.31 
 
 
366 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  37.56 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.44 
 
 
408 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  38.41 
 
 
363 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 
410 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  39.46 
 
 
385 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  39.16 
 
 
385 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  39.16 
 
 
385 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.69 
 
 
365 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  31.5 
 
 
387 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.2 
 
 
392 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 
377 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  35.12 
 
 
413 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  30.97 
 
 
387 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  33.55 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  32.75 
 
 
381 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  36.68 
 
 
428 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  32.54 
 
 
375 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  36.68 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  37.11 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  33.15 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  36.69 
 
 
418 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  34.43 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  33.55 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  35.77 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  39.83 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  32.74 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.68 
 
 
392 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 
383 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  33.84 
 
 
396 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  39.83 
 
 
374 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.96 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.12 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 
469 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
377 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.15 
 
 
400 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
381 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
388 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 
376 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  35.4 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  37.28 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  35.85 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  32.27 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 
400 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 
406 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.87 
 
 
388 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.2 
 
 
397 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  33.51 
 
 
391 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  34.22 
 
 
382 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
400 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  33 
 
 
392 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
374 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  36.46 
 
 
394 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
403 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
386 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 
388 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 
379 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 
374 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 
415 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>