More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0552 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  720    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  46.73 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.13 
 
 		 369 aa  268  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  45.64 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  41.45 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  41.23 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  41.69 
 
 		 406 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  41.52 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  38.71 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  42.26 
 
 		 369 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  41.32 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  38.89 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  41.37 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  39.29 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  39.07 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  37.58 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  41.28 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  40.71 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  36.78 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.75 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  37.64 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  42.69 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  36.18 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  41.36 
 
 		 442 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  35.22 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  35.48 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  36.83 
 
 		 388 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  34.92 
 
 		 530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.84 
 
 		 809 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  37.88 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  34.07 
 
 		 390 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  38 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.8 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.88 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  34.05 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  34.99 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.38 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  35.49 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.81 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.64 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.31 
 
 		 729 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  34.84 
 
 		 377 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.92 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  34.17 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  34.82 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  34.27 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  36.23 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  33.92 
 
 		 383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.52 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  30.25 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  32.84 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  32.48 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  34.01 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  33.04 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  31.74 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.7 
 
 		 428 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  31.32 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.43 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  31.27 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  30.97 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 462 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  32.53 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  31.97 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  32.28 
 
 		 403 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>