More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2543 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 377 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  55.33 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  51.94 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  47.79 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  49.85 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.24 
 
 		 809 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  48.78 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  47.85 
 
 		 374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  49.68 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  50.81 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  43.96 
 
 		 389 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 343 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  46.75 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  47.88 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 		 357 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  48.25 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  42.51 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  46.15 
 
 		 399 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  48.68 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  43.25 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  46.57 
 
 		 442 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  43.41 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  48.22 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  36.59 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  38.17 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 		 369 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.05 
 
 		 729 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  40.8 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.28 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  37.76 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.16 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  37.61 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  36.45 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  35.34 
 
 		 443 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  36.48 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 432 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.84 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32.26 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.46 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.69 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  34.21 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  33.85 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  35.48 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.17 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  32.72 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 		 413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  32.67 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  34.59 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.86 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  30.47 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  32.48 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  32.23 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  32.35 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 		 418 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  30.81 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  35.28 
 
 		 399 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  32.86 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.13 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  33.14 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  32.06 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.76 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  31.69 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  34.02 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  32.86 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  35.24 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  32.55 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  39.47 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  33.81 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>