281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0307 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  794    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  79.62 
 
 		 377 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  78.72 
 
 		 379 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  71.58 
 
 		 407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  59.12 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  56.6 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  50.13 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  49.37 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  52.22 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  53.41 
 
 		 377 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  49.85 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  47.28 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  48.38 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  43.31 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  40.52 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  42.51 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  39.79 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  42.41 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  41.69 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  41.69 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  38.5 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  40.37 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  42.15 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  42.48 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  42.57 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  38.57 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4500  glucose sorbosone dehydrogenase  38.42 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0327398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  40.92 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  37.77 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  42.45 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  37.16 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.6 
 
 		 374 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.53 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  39.15 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  38.08 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.33 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  39.94 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  37.7 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  39.57 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  39.71 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  39.19 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  39.55 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  38.9 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  40.11 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  36.43 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  38.21 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.9 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  38.74 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  40.35 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  39.71 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  37.63 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  36.24 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  35.65 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  39.31 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  36.15 
 
 		 406 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 397 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  38.99 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  39.17 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  38.69 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  35.26 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  38.51 
 
 		 376 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  35.05 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  37.09 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  38.02 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  36.39 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 466 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  35.38 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  39.17 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  36.62 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  35.39 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  39.22 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  37.67 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  35.23 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  40.23 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  35.69 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  37.33 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  37.98 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  35.77 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  36.19 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  39.83 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.27 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  36.79 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  36.01 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  38.86 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.19 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  37.03 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  36.19 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  35.57 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  36.55 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>