More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3278 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
394 aa  782    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  64.13 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  51.02 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  51.73 
 
 
369 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  48.01 
 
 
381 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  46.17 
 
 
374 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  48.53 
 
 
404 aa  288  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  49.23 
 
 
388 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  44.93 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.12 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  44.5 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  47.66 
 
 
360 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  45.55 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  44.11 
 
 
405 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  49.25 
 
 
399 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  42.25 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  43.27 
 
 
369 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  48.33 
 
 
388 aa  259  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  48.01 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 
381 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  46.11 
 
 
343 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.58 
 
 
809 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  43.57 
 
 
394 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.26 
 
 
369 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  46.67 
 
 
377 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  42.16 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  43.29 
 
 
367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.37 
 
 
360 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  38.19 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  35.02 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 
363 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.75 
 
 
729 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  36.63 
 
 
366 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  35.61 
 
 
385 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  35.61 
 
 
385 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.15 
 
 
365 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 
385 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 
405 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 
360 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  33.94 
 
 
443 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.46 
 
 
399 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.94 
 
 
382 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.69 
 
 
392 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 
380 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  38.02 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  35.22 
 
 
396 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  35.39 
 
 
391 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  35.47 
 
 
387 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 
387 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  31.75 
 
 
397 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 
376 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 
379 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.29 
 
 
388 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 
367 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05411  glucose dehydrogenase-B  30.97 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  32.73 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
395 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  32.24 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 
390 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.11 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  35.35 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  34.87 
 
 
387 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.71 
 
 
391 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  34.62 
 
 
381 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.91 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  35.01 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  34.76 
 
 
376 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.48 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  34.69 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.85 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.19 
 
 
413 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32.76 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 
428 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  30.79 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.62 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  31.5 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  34.94 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 
359 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  34.46 
 
 
394 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.88 
 
 
389 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.06 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
388 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.07 
 
 
392 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 
432 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  30.71 
 
 
430 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.63 
 
 
384 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 
410 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  34.31 
 
 
382 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>