More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4365 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 381 aa  769    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  52.51 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  51.08 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  48.53 
 
 		 406 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  45.62 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  46 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  46.54 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  46.73 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  45.96 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  47.5 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.17 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  41.11 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  46.06 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.05 
 
 		 809 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  38.58 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  40.67 
 
 		 399 aa  246  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  41.69 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  41.64 
 
 		 353 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38.4 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  39.6 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.57 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  38.21 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.21 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  39.41 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  36.12 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  35.23 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  39.07 
 
 		 360 aa  208  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.11 
 
 		 729 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.13 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  34.69 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.52 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.34 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.93 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.77 
 
 		 365 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  34.97 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.14 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.11 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  32.15 
 
 		 469 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.18 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.64 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  29.88 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  32.04 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  29.79 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 400 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.54 
 
 		 405 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.92 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.13 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.76 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  28.41 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.01 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  31.72 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  30.88 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  27.21 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.14 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  26.97 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  29.55 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  32.57 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  29.95 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  28.49 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  27.35 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.62 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.32 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.92 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  29.68 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  27.62 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.62 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1958  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.6 
 
 		 497 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.922706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>