184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.25 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  40.91 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.61 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  40.07 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  40.07 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  40.07 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  40.91 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  38.36 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  38.46 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  34.97 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  32.77 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  34.36 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.07 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.09 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  35.15 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.44 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  34.6 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.57 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  33.03 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.96 
 
 		 809 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.5 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  34.97 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.47 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.57 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.64 
 
 		 729 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.69 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.04 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  34.35 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.15 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  27.95 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.98 
 
 		 1657 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  33 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  25.19 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1958  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.54 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.922706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.95 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  25.3 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  23.95 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.25 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.08 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.51 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  25.26 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.22 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.08 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  30.72 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  24.68 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  27.6 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.82 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  27.13 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  24.68 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  24.68 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  26.03 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  27.23 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  25.38 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  25.56 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  30.67 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  23.87 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  26.8 
 
 		 972 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.3 
 
 		 1505 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>