271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2489 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  759    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  67.47 
 
 
367 aa  512  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.39 
 
 
450 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.08 
 
 
388 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.58 
 
 
455 aa  346  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.16 
 
 
451 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.97 
 
 
388 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.87 
 
 
387 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.78 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.24 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.43 
 
 
403 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.16 
 
 
414 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  42.97 
 
 
422 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.16 
 
 
392 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  45.33 
 
 
461 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.33 
 
 
460 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  43.8 
 
 
419 aa  258  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  39.79 
 
 
475 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  42.2 
 
 
482 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.05 
 
 
442 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.54 
 
 
570 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  39.66 
 
 
676 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  36.18 
 
 
471 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  40.48 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 
520 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  34.76 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 
875 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  41.39 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  32.98 
 
 
766 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  33.98 
 
 
748 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  33.97 
 
 
2172 aa  173  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  37.19 
 
 
342 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.84 
 
 
585 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  34.53 
 
 
518 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 
399 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.47 
 
 
841 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  30.64 
 
 
561 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.98 
 
 
1657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  29.79 
 
 
712 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  35.32 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.01 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.49 
 
 
374 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  33.22 
 
 
392 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.1 
 
 
1029 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 
388 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  26.93 
 
 
530 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 
395 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 
418 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  26.63 
 
 
388 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  30.19 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  29.06 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 
430 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  29.41 
 
 
358 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.8 
 
 
378 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  26.9 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.18 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  28.08 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  28.93 
 
 
388 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.67 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  31.18 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.18 
 
 
385 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.78 
 
 
381 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.02 
 
 
372 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.79 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  27.7 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  29.38 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  27.49 
 
 
465 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.2 
 
 
382 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.27 
 
 
371 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  27.83 
 
 
428 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  27.83 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  26.36 
 
 
371 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.36 
 
 
371 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  26.36 
 
 
371 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  26.92 
 
 
383 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  25.74 
 
 
371 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  25.74 
 
 
371 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.36 
 
 
371 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.8 
 
 
392 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  26.61 
 
 
373 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 
385 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  26.09 
 
 
371 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  31.9 
 
 
999 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 
375 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  27.86 
 
 
476 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 
405 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.04 
 
 
381 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>