232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0303 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1065    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  41.92 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.69 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.47 
 
 		 387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  34.53 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  33.23 
 
 		 422 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  27.98 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  35.35 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.43 
 
 		 367 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.99 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  32.05 
 
 		 2172 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 676 aa  124  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  28.53 
 
 		 766 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.23 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.66 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.03 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.34 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  34.56 
 
 		 400 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.98 
 
 		 875 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.94 
 
 		 403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  31.18 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.12 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.75 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 520 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.52 
 
 		 388 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  30 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.28 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.98 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  28.77 
 
 		 748 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.39 
 
 		 712 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.59 
 
 		 570 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  26.93 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  35.37 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.38 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  34.1 
 
 		 999 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  34.1 
 
 		 999 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.99 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.66 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  33.53 
 
 		 999 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.01 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0136  hypothetical protein  27.31 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.73272  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  28.24 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.02 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  35.34 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.62 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  30.37 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.14 
 
 		 841 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  32.59 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  25.75 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.43 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32 
 
 		 729 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  26.89 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  26.32 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  24.43 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  25.18 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  25.52 
 
 		 370 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.12 
 
 		 892 aa  67.4  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.13 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  25.82 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.13 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  37.17 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  26.96 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  27.24 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  27.24 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.8 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  32.33 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  29.49 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  25.73 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  26.25 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  35.16 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.85 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.61 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  36.7 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  36.7 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  25.93 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.07 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  39.66 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.57 
 
 		 1657 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  42.72 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  28.35 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001471  pQQ-dependent oxidoreductase gdhB family  31.18 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  25.78 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  25.58 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  24.72 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  27.84 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>