255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5756 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
460 aa  917    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.46 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.35 
 
 
388 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  44.92 
 
 
371 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.29 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.82 
 
 
367 aa  279  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.1 
 
 
455 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.43 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.57 
 
 
388 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  42.54 
 
 
419 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.55 
 
 
396 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  42.94 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.49 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.5 
 
 
403 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.74 
 
 
442 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.27 
 
 
387 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  44.23 
 
 
461 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.72 
 
 
414 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.5 
 
 
570 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  39.12 
 
 
482 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  38.99 
 
 
400 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  41.45 
 
 
475 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  37.29 
 
 
471 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  35.31 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  33.06 
 
 
676 aa  176  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  35.14 
 
 
766 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  33.41 
 
 
875 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.61 
 
 
520 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  40.2 
 
 
748 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.12 
 
 
488 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.44 
 
 
2172 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.32 
 
 
1657 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.85 
 
 
342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.86 
 
 
585 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  33.15 
 
 
712 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.86 
 
 
1029 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.09 
 
 
518 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.51 
 
 
972 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.83 
 
 
841 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.8 
 
 
999 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.53 
 
 
999 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.53 
 
 
999 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.68 
 
 
263 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.17 
 
 
408 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 
399 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.75 
 
 
1132 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 
388 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 
388 aa  99  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  26.65 
 
 
561 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  24.7 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  31.85 
 
 
908 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  27.41 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  27.2 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  42.28 
 
 
192 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 
432 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.48 
 
 
892 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  27.41 
 
 
397 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 
428 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  29.55 
 
 
1138 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 
428 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 
386 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
374 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  25.89 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
374 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30.17 
 
 
1151 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  31.05 
 
 
984 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 
385 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.54 
 
 
1142 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 
378 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.32 
 
 
1200 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  27.89 
 
 
918 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  28.45 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  27.61 
 
 
941 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.47 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 
394 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  25.56 
 
 
388 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  25.62 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  27.18 
 
 
476 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  26.76 
 
 
476 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  27.65 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  26.55 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  26.55 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.04 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  27.8 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  25.79 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.44 
 
 
729 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  26.3 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  25.76 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  27.2 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.13 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  26.71 
 
 
476 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  26.41 
 
 
476 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  29.39 
 
 
1135 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  26.3 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>