40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1798 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.33 
 
 		 450 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.38 
 
 		 427 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.15 
 
 		 388 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.5 
 
 		 367 aa  104  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.18 
 
 		 388 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.18 
 
 		 451 aa  97.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  41.91 
 
 		 419 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.28 
 
 		 460 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  41.89 
 
 		 371 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.55 
 
 		 392 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.94 
 
 		 455 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  42.55 
 
 		 422 aa  95.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.48 
 
 		 396 aa  91.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.6 
 
 		 403 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.79 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.3 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.13 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  34.42 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  35.4 
 
 		 469 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.67 
 
 		 442 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  31.55 
 
 		 482 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  32.45 
 
 		 461 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  33.7 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  29.9 
 
 		 676 aa  61.6  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.41 
 
 		 2172 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.01 
 
 		 570 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.74 
 
 		 892 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  37.82 
 
 		 475 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.1 
 
 		 712 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  22.99 
 
 		 561 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 1132 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  32.52 
 
 		 766 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  34.16 
 
 		 841 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  30.11 
 
 		 400 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.61 
 
 		 518 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 999 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 999 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 999 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.02 
 
 		 1657 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>