245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0989 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  980    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.48 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.23 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  39.79 
 
 		 371 aa  256  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.87 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.31 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.21 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.41 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.02 
 
 		 388 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  36.17 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  31.44 
 
 		 676 aa  183  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.72 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.45 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.5 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.55 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  35.36 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  34.56 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.7 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.25 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.45 
 
 		 570 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.22 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  36.71 
 
 		 400 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  32.7 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  28.94 
 
 		 875 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  28.78 
 
 		 766 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  33.96 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.99 
 
 		 520 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  33.23 
 
 		 748 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  28.05 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.11 
 
 		 1657 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.39 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.48 
 
 		 712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.56 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.39 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.72 
 
 		 2172 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.79 
 
 		 1029 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  27.95 
 
 		 370 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 374 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 374 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  28.48 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  26.93 
 
 		 518 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.37 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  32.38 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.27 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  26.01 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  27.34 
 
 		 841 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.93 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  34.68 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 367 aa  87.4  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 		 392 aa  87  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 406 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  27.19 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  24.92 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  28.62 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 		 1444 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 1200 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.62 
 
 		 1505 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.23 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  28.67 
 
 		 908 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.04 
 
 		 1151 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  29.47 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  26.79 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  27.17 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  26.86 
 
 		 1142 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  27.17 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  26.33 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  26.77 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  28.02 
 
 		 972 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.33 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  26.73 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.04 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  27.13 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  26.57 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.88 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  28.27 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  28.37 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  29.22 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  26.95 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  26.92 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  25.3 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  27.8 
 
 		 909 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  27.21 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>