257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2421 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 676 aa  1351    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  49.14 
 
 		 875 aa  551  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  49.71 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  49.65 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  40.61 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  33.84 
 
 		 766 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  37.92 
 
 		 469 aa  242  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  41.75 
 
 		 748 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  39.66 
 
 		 371 aa  224  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  39.47 
 
 		 422 aa  221  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.19 
 
 		 387 aa  210  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.5 
 
 		 427 aa  207  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.72 
 
 		 367 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.83 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.65 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.17 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.71 
 
 		 396 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  31.44 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.84 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.63 
 
 		 403 aa  170  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.61 
 
 		 461 aa  161  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.25 
 
 		 460 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  34.58 
 
 		 419 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.28 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  33.72 
 
 		 2172 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.17 
 
 		 442 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.24 
 
 		 392 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.28 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2420  blue (type1) copper domain-containing protein  64.42 
 
 		 159 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1285  blue (type 1) copper domain protein  47.18 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00926842  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.56 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 561 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.22 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.37 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.47 
 
 		 841 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.84 
 
 		 1657 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.56 
 
 		 712 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  43.84 
 
 		 188 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.13 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.43 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 367 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 999 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  34.08 
 
 		 999 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  34.08 
 
 		 999 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 366 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.83 
 
 		 488 aa  94.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 		 363 aa  94.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.65 
 
 		 394 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.89 
 
 		 729 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 		 369 aa  90.9  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  26.12 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  27.91 
 
 		 972 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  32.29 
 
 		 908 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.88 
 
 		 381 aa  88.2  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  25.88 
 
 		 476 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  26.35 
 
 		 476 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  26.82 
 
 		 476 aa  87.8  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  25.76 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 		 399 aa  83.2  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.21 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.54 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  27.46 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  27.83 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.51 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  24.78 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  24.76 
 
 		 476 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.84 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  30.73 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.02 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 		 1200 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  26.9 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  26.64 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  26.74 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.76 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  25.08 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  27.03 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.94 
 
 		 1138 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>