245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4405 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  100 
 
 		 471 aa  960    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  44.53 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  42.72 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  40.61 
 
 		 676 aa  315  8e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  41.97 
 
 		 766 aa  294  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  40.28 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  39.15 
 
 		 875 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38 
 
 		 450 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  39.01 
 
 		 748 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  36.68 
 
 		 371 aa  223  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.93 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.28 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.15 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.8 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.07 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.98 
 
 		 388 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.14 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.92 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.01 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  37.47 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.99 
 
 		 388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  33.96 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.59 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.94 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.38 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.07 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  33.02 
 
 		 475 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.44 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  32.05 
 
 		 712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.31 
 
 		 2172 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.77 
 
 		 841 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.96 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.05 
 
 		 1657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  34.92 
 
 		 1029 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  30.15 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.48 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.21 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.46 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.86 
 
 		 488 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  30.56 
 
 		 918 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.99 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.99 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 1505 aa  97.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  28.44 
 
 		 941 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  28.82 
 
 		 908 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 385 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  26.77 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  26.77 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  31.53 
 
 		 1138 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  26.25 
 
 		 999 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.38 
 
 		 945 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.42 
 
 		 365 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.07 
 
 		 363 aa  90.1  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 		 385 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  29.94 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  25.8 
 
 		 408 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.31 
 
 		 1182 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.23 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.06 
 
 		 953 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  24.16 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  28.87 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.72 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  28.67 
 
 		 1142 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 1151 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 1200 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  28.37 
 
 		 918 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  25.7 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  32.42 
 
 		 909 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.4 
 
 		 892 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.87 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  28.88 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  26.63 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.29 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  25.98 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.12 
 
 		 1444 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  27.94 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.18 
 
 		 1135 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  24.47 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  25.58 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.48 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  24.83 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  23.92 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  27.53 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  23.85 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>