More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3787 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  54.08 
 
 		 1505 aa  825    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  49.19 
 
 		 1444 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 945 aa  1895    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  66.37 
 
 		 953 aa  1014    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.68 
 
 		 1200 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  41.38 
 
 		 941 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  43.51 
 
 		 1135 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  41.9 
 
 		 1143 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 1151 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  39.76 
 
 		 918 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  40.6 
 
 		 1142 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  38.23 
 
 		 1182 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  37.25 
 
 		 1138 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  36.38 
 
 		 908 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  39.07 
 
 		 918 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  39.5 
 
 		 984 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  38.18 
 
 		 909 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 800 aa  263  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  35.6 
 
 		 1194 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.49 
 
 		 1029 aa  191  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.96 
 
 		 841 aa  173  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  27.94 
 
 		 712 aa  165  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  29.19 
 
 		 1081 aa  162  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 892 aa  157  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  27.65 
 
 		 999 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  27.65 
 
 		 999 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.2 
 
 		 999 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  32.59 
 
 		 679 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  31.73 
 
 		 610 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.39 
 
 		 1657 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  24.42 
 
 		 972 aa  104  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.61 
 
 		 442 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  38.32 
 
 		 951 aa  99  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  30.04 
 
 		 673 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  28.77 
 
 		 422 aa  98.2  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  29.92 
 
 		 1391 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  25.55 
 
 		 387 aa  97.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.56 
 
 		 863 aa  94.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.48 
 
 		 387 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1167 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  40.71 
 
 		 912 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  40.46 
 
 		 501 aa  92.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  42.97 
 
 		 604 aa  92  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 430 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 		 1122 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  28.74 
 
 		 471 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 413 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  25.17 
 
 		 366 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 392 aa  88.2  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.84 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 		 1015 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.84 
 
 		 374 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  34.5 
 
 		 971 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  40.8 
 
 		 746 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.71 
 
 		 387 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  25.16 
 
 		 378 aa  86.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  26.15 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.77 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  26.38 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  24.27 
 
 		 391 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.17 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  24.42 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  25.27 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  24.16 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 		 536 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  28.31 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.36 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 		 780 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  28.33 
 
 		 967 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  38.93 
 
 		 928 aa  84.7  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  29.5 
 
 		 381 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 		 377 aa  84  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  39.06 
 
 		 1164 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  32.57 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  47.47 
 
 		 995 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.58 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  27.72 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.43 
 
 		 2172 aa  81.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  34.7 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.87 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 407 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  37.72 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.66 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  25.66 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  48.94 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  25.15 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  36.64 
 
 		 965 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  34.69 
 
 		 971 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  34.69 
 
 		 1018 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  35.4 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  26.9 
 
 		 982 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  25.88 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  24.61 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>