More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4181 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 570 aa  1166    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.44 
 
 		 455 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.61 
 
 		 388 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  41.82 
 
 		 371 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.15 
 
 		 451 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.56 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.11 
 
 		 450 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.04 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.66 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.94 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.21 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.23 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.18 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  38.04 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.34 
 
 		 392 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  38.83 
 
 		 419 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.31 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.42 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  34.16 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  34.25 
 
 		 2172 aa  160  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.47 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  38.9 
 
 		 488 aa  157  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.35 
 
 		 403 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  35.15 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  30.56 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  31.28 
 
 		 676 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.09 
 
 		 1657 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  29.79 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  32.17 
 
 		 875 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  37.07 
 
 		 400 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.32 
 
 		 1132 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.18 
 
 		 712 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  28.95 
 
 		 766 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.78 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.47 
 
 		 841 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  31.29 
 
 		 972 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.69 
 
 		 342 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  30.32 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.04 
 
 		 1575 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  34.5 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  32.24 
 
 		 748 aa  99.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.8 
 
 		 809 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.17 
 
 		 729 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  34.86 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.78 
 
 		 999 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.78 
 
 		 999 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 999 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  31.86 
 
 		 1151 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  33.2 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.59 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  28.1 
 
 		 918 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  32.97 
 
 		 803 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 1142 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  31.45 
 
 		 918 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.95 
 
 		 1029 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 		 385 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 800 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1029 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 		 385 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  37.07 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.68 
 
 		 941 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  33.15 
 
 		 477 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 		 381 aa  87.8  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  30.56 
 
 		 1174 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  34.14 
 
 		 369 aa  87.4  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  34.04 
 
 		 343 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 405 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.6 
 
 		 369 aa  86.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.23 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1215 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.08 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  26.63 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1135 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1294 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1003 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.68 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  26.32 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.71 
 
 		 892 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  26.99 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  32.53 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  25.54 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  26.52 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  33.15 
 
 		 736 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  25.94 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.88 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  25.69 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.47 
 
 		 1138 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  25.44 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  26.16 
 
 		 984 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>